Des hostilités surviennent entre le Tswanas et les tribus Ndebele fin des années 1800. Ces tribus souhaitent migrer sur ce territoire en passant par le désert du Kalahari. Des tensions se mettent en place par la suite avec les colons Boers venant du Transvaal. Les dirigeants du Botsawan demandent une assistance. A la suite de cet appel le gouvernement britannique met le Bechuanaland sous sa protection en mars 1885. La partie nord forme ainsi le Botswana actuel. La partie sud du territoire est intégrée à la colonie du Cap (actuelle province nord-ouest de l’Afrique du Sud).
- En 1910 : création de l'Union de l'Afrique du Sud
- En 1920 : création de deux conseils consultatifs représentant les Africains et les Européens
- En 1948 : le National Party est élu au gouvernement, et il institue l'apartheid en Afrique du Sud
- En 1951 : un conseil consultatif euro-africain est formé
- En 1961 : création d’un conseil consultatif législatif et le National Party se retire de la communauté du Commonwealth of Nations
Il n’y aura donc aucune perspective d’intégration du protectorat du Bechuanaland, le Basutoland (actuel Lesotho) et le Swaziland (les High Commission Territories) en Afrique du Sud.
- En 1964 : la Grande-Bretagne accepte de créer un gouvernement autonome élu démocratiquement au Botswana.
- En 1965 : Gaborone devient la capitale officielle
- Le 30 septembre 1966 : Indépendance du Botswana
De nombreux présidents se succèdent, l’actuel président, est le lieutenant-général Seretse Khama Ian Khama qui entre en fonction en 2008.